Nitrificatie speelt een belangrijke rol in de biologische waterzuivering bij het verwijderen van stikstof uit het afvalwater.
Een biologische waterzuivering bestaat in grote lijnen uit een reactietank waarin bacteriën de aanwezig vervuiling afbreken.
Een biologische zuivering kan volledig worden uitgevoerd in één enkele tank. Hierbij zal het afvalwater dan batchgewijs worden behandeld.